产品货号:
BTN15-46800
中文名称:
盖塔病毒(GETV)荧光定量RT-PCR试剂盒(探针法)
英文名称:
Getah Virus Probe qRT-PCR Kit
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是百奥莱博公司以探针法荧光定量RT-qPCR技术为基础开发的,专门用于盖塔病毒研究检测的试剂盒。
盖塔病毒(Getah virus,GETV)属于RNA病毒披膜病毒科(Togaviridae)甲病毒属(Alphavirus)成员,是一种经蚊虫在脊椎动物中传播的虫媒病毒,广泛分布于东南亚和东亚地区。已证实GETV可引起家畜的疾病,如日本和印度曾多次发生该病毒感染马或猪而导致的疾病流行,近期我国湖南省某地猪群中也发生盖塔病毒病的流行。GETV血清学调查表明,人、多种家畜及某些野生动物中也存在该病毒感染,亚洲、欧洲、大洋洲一些国家的人、猪、马、牛、山羊、犬、兔、袋鼠、鸡和野鸟血清中均检测到GETV病毒抗体,因此快速检测盖塔病毒具有重要的意义。
- 即开即用,用户只需要提供样品RNA模板。
- 引物和探针经过优化,分析灵敏性高,可以达到100拷贝/反应。
- 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
- 特异性高,引物是根据盖塔病毒RNA高度保守区设计,不会跟其他生物的RNA发生交叉反应。
- 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。
组分 | 规格 |
探针法qRT-PCR缓冲液 | 500μL |
探针法qRT-PCR酶混合液 | 50μL |
荧光PCR专用模板稀释液 | 1mL |
盖塔病毒qRT-PCR引物-探针干粉 | 50T |
盖塔病毒qRT-PCR阳性对照(1×107拷贝/μL) | 50μL |
保存:-20℃,有效期1年。
盖塔病毒qRT-PCR引物-探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入165μL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
一、稀释标准曲线样品
以101~106拷贝/μL这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本制品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
- 标记6个离心管,分别为6、5、4、3、2、1。
- 用带芯枪头分别加入45μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
- 在6号管中加入5μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×106拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
- 换枪头,在5号管中加入5μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×105拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
- 换枪头,在4号管中加入5μL 1×105拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×104拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
- 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品DNA的制备
- 如果有N个样品,最好设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10μL上步所得4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为NC。
- 用自选方法纯化样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数样品RNA提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
三、Probe qRT-PCR反应
- 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),1个用于RT-PCR阳性对照(直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
- 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
成分 样品管
N+2个PCR阴性
对照标准曲线样品管
(1~6管)探针法qRT-PCR缓冲液 各10μL 10μL 各10μL 探针法qRT-PCR酶混合液 各1μL 1μL 各1μL 盖塔病毒qRT-PCR引物-探针混合液 各3μL 3μL 各3μL N+2个待测RNA样本 各6μL 不加 不加 超纯水 不加 6μL 不加 第6步所得标准曲线样品稀释液(1~6号) 不加 不加 各6μL - 盖上盖子后上机,按下面参数进行RT-PCR:
过程 温度 时间 逆转录 50℃ 10min 预变性 95℃ 10min PCR反应
(40个循环)95℃ 15sec 60℃ 60sec(采集FAM通道的荧光信号,
淬灭基团为NFQ)
四、数据处理
- 如果样本制备阳性对照或RT-PCR阳性对照(包括标曲样本)结果为阴性,则整个实验无效,不需要分析数据,需要重新样本制备,重新进行RT-PCR扩增或跟厂家联系。如果样本制备阴性对照或RT-PCR阴性对照结果为阳性,说明环境污染,则整个实验无效,不需要分析数据,需要跟厂家联系。
- 如果阴性对照和阳性对照均正常,则实验有效,可以进入后续分析。
- 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。
- 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须没有读数,或者大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于40。对待测样品,如果其Ct没有读数、大于或等于40则均为阴性,如果小于40则为阳性。
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