产品货号:
WH0058
中文名称:
石蜡包埋组织总RNA提取试剂盒
英文名称:
Total RNA Extraction Kit from Paraffin Embedded Tissues
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒可从福尔马林固定石蜡包埋组织切片(以下简称FFPE)中提取总RNA。由于固定和包埋的条件限制,FFPE样本核酸通常发生片段化并且会被甲醛化学修饰,因此较难提取,本试剂盒提取的RNA可应用于RT-PCR等下游试验。
产品应用:
·采用硅基质膜柱法纯化方式,在可能的程度内获得的总RNA纯度更高、信息更为完整。
·相对于传统方法,操作更为简便、快捷。
·适用于下游的RT-PCR或RT-qPCR等实验检测。
提取实例:
上图为本试剂盒提取大鼠肝脏石蜡包埋切片样本总RNA,用50μl RNase-free ddH2O洗脱后,取8μl上样,1%琼脂糖凝胶,6V/cm电泳20min。起始量:约15mg组织。
试剂盒组成:
储存条件:室温(15-25℃)保存。DNase I,缓冲液RDD和RNase-Free ddH2O(管装)置于2-8℃保存。
自备试剂:二甲苯、无水乙醇
使用前注意事项:
1.第一次使用前应在漂洗液RW中加入无水乙醇,加入量请参见瓶上标签。
2.DNase I储存液的配制:将DNase I干粉(1500U)溶解在550μl RNase-Free ddH2O中,轻柔混匀,分装后-20℃贮存(可保存9个月)。
注意:从-20℃融化后的DNase I储存液保存于4℃(可保存6周),不要再次冻存。
起始材料:
1.标准的福尔马林固定石蜡包埋程序也常常会造成核酸的片段化。为了尽量降低RNA片段化的可能性,应该按照以下操作步骤进行样本处理:
·组织切除后应尽快浸入4%-10%的福尔马林溶液中;
·固定时间最好为14-24h(固定时间过长会导致RNA片段化更严重,不利于下游的试验;
·样本包被之前必须彻底脱水。
2.应采用新鲜的FFPE组织切片,切片厚度不超过10μm,切片过厚可能会造成RNA得率低,每次制备采用的切片数应不超过8片,表面积应不超过250mm2。
3.如果没有起始样本的信息,建议初次制备采用的切片数应不超过2片,然后根据RNA的得率和纯度,下次制备采用的切片数可以进行调整,但应不超过8片。
操作步骤:
1.将石蜡样品切成5-10μm厚的片状。
注意:如果样品表面暴露于空气中,最初的2~3片弃掉不用。
2.迅速将2-8张切片置于1.5ml RNase-Free的离心管中,加入1 ml二甲苯,剧烈涡旋10 sec。
3.室温(15-25℃),12000rpm (~13400×g)离心2min。
4.用枪头吸除上清,小心不要吸到沉淀。
5.加入1 ml无水乙醇于沉淀中,涡旋混匀。
6.室温(15-25℃),12000rpm (~13400×g)离心2min。
7.用枪头吸除上清,小心不要吸到沉淀(用一个新的枪头小心吸出残余的乙醇)。
8.打开管盖,室温(15-25℃)或37℃放置10 min直至残余的乙醇挥发完全。
注意:完全去除残余的乙醇很重要,残余的乙醇会对RNA产生影响。
9.加入200 μl裂解液RF以及10 μl Proteinase K于沉淀中,彻底涡旋混匀。
10.55℃孵育15 min之后80℃孵育15 min。
11.室温(15-25℃),12000rpm(~13400×g)离心5 min,转移上清入新的RNase-Free离心管中。
12.加入220 μl的缓冲液RB,涡旋混匀。
13.加入660 μl的无水乙醇,涡旋混匀(可能会出现沉淀)。
14.转移700 μl溶液和沉淀入吸附柱CR3中(吸附柱放在收集管中),12000rpm(~13400×g)离心1 min,弃掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
15.重复步骤14,直到所有的溶液和沉淀完全通过吸附柱CR3,弃废液,将吸附柱CR3放回收集管中。
16.DNase I工作液的配制:取10 μl DNase I储存液放入新的RNase-Free离心管中,加入70 μl RDD溶液,轻柔混匀。
17.向吸附柱CR3中央加入80 μl的DNase I工作液,室温放置15 min。
18.向吸附柱CR3中加入500 μl去蛋白液RW1,室温(15-25℃),12000rpm (~13400×g)离心30-60 sec,弃废液,将吸附柱放回收集管中。
19.向吸附柱CR3中加入500 μl漂洗液RW(使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm(~13400×g)离心30-60 sec,弃废液,将吸附柱CR3放回收集管中。
20.重复步骤19。
21.室温(15-25℃),12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:此步骤目的是将吸附柱CR3中残余的漂洗液去除,漂洗液的残留,可能会影响后续的RT等实验。
22.将吸附柱CR3转入一个新的RNase-Free离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加30-100 μl RNase-Free ddH2O,室温放置2min,12000rpm(~13400×g)离心2min,得到RNA溶液。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于30 μl,体积过小影响回收效率。RNA溶液请于-70℃保存。配置胶用RNA专用系统。
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产品应用:
·采用硅基质膜柱法纯化方式,在可能的程度内获得的总RNA纯度更高、信息更为完整。
·相对于传统方法,操作更为简便、快捷。
·适用于下游的RT-PCR或RT-qPCR等实验检测。
提取实例:
上图为本试剂盒提取大鼠肝脏石蜡包埋切片样本总RNA,用50μl RNase-free ddH2O洗脱后,取8μl上样,1%琼脂糖凝胶,6V/cm电泳20min。起始量:约15mg组织。
试剂盒组成:
组分 | 50T |
裂解液RF | 12ml |
缓冲液RB | 12ml |
去蛋白液RW1 | 40ml |
漂洗液RW | 12ml |
Proteinase K | 500μl |
RNase-Free ddH2O(瓶装) | 40ml |
RNase-Free吸附柱CR3(含2ml收集管) | 50套 |
DNase I | 1500U |
缓冲液RDD | 4ml |
RNase-Free ddH2O(管装) | 1ml |
RNase-Free离心管(1.5ml) | 50个 |
储存条件:室温(15-25℃)保存。DNase I,缓冲液RDD和RNase-Free ddH2O(管装)置于2-8℃保存。
自备试剂:二甲苯、无水乙醇
使用前注意事项:
1.第一次使用前应在漂洗液RW中加入无水乙醇,加入量请参见瓶上标签。
2.DNase I储存液的配制:将DNase I干粉(1500U)溶解在550μl RNase-Free ddH2O中,轻柔混匀,分装后-20℃贮存(可保存9个月)。
注意:从-20℃融化后的DNase I储存液保存于4℃(可保存6周),不要再次冻存。
起始材料:
1.标准的福尔马林固定石蜡包埋程序也常常会造成核酸的片段化。为了尽量降低RNA片段化的可能性,应该按照以下操作步骤进行样本处理:
·组织切除后应尽快浸入4%-10%的福尔马林溶液中;
·固定时间最好为14-24h(固定时间过长会导致RNA片段化更严重,不利于下游的试验;
·样本包被之前必须彻底脱水。
2.应采用新鲜的FFPE组织切片,切片厚度不超过10μm,切片过厚可能会造成RNA得率低,每次制备采用的切片数应不超过8片,表面积应不超过250mm2。
3.如果没有起始样本的信息,建议初次制备采用的切片数应不超过2片,然后根据RNA的得率和纯度,下次制备采用的切片数可以进行调整,但应不超过8片。
操作步骤:
1.将石蜡样品切成5-10μm厚的片状。
注意:如果样品表面暴露于空气中,最初的2~3片弃掉不用。
2.迅速将2-8张切片置于1.5ml RNase-Free的离心管中,加入1 ml二甲苯,剧烈涡旋10 sec。
3.室温(15-25℃),12000rpm (~13400×g)离心2min。
4.用枪头吸除上清,小心不要吸到沉淀。
5.加入1 ml无水乙醇于沉淀中,涡旋混匀。
6.室温(15-25℃),12000rpm (~13400×g)离心2min。
7.用枪头吸除上清,小心不要吸到沉淀(用一个新的枪头小心吸出残余的乙醇)。
8.打开管盖,室温(15-25℃)或37℃放置10 min直至残余的乙醇挥发完全。
注意:完全去除残余的乙醇很重要,残余的乙醇会对RNA产生影响。
9.加入200 μl裂解液RF以及10 μl Proteinase K于沉淀中,彻底涡旋混匀。
10.55℃孵育15 min之后80℃孵育15 min。
11.室温(15-25℃),12000rpm(~13400×g)离心5 min,转移上清入新的RNase-Free离心管中。
12.加入220 μl的缓冲液RB,涡旋混匀。
13.加入660 μl的无水乙醇,涡旋混匀(可能会出现沉淀)。
14.转移700 μl溶液和沉淀入吸附柱CR3中(吸附柱放在收集管中),12000rpm(~13400×g)离心1 min,弃掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
15.重复步骤14,直到所有的溶液和沉淀完全通过吸附柱CR3,弃废液,将吸附柱CR3放回收集管中。
16.DNase I工作液的配制:取10 μl DNase I储存液放入新的RNase-Free离心管中,加入70 μl RDD溶液,轻柔混匀。
17.向吸附柱CR3中央加入80 μl的DNase I工作液,室温放置15 min。
18.向吸附柱CR3中加入500 μl去蛋白液RW1,室温(15-25℃),12000rpm (~13400×g)离心30-60 sec,弃废液,将吸附柱放回收集管中。
19.向吸附柱CR3中加入500 μl漂洗液RW(使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm(~13400×g)离心30-60 sec,弃废液,将吸附柱CR3放回收集管中。
20.重复步骤19。
21.室温(15-25℃),12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:此步骤目的是将吸附柱CR3中残余的漂洗液去除,漂洗液的残留,可能会影响后续的RT等实验。
22.将吸附柱CR3转入一个新的RNase-Free离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加30-100 μl RNase-Free ddH2O,室温放置2min,12000rpm(~13400×g)离心2min,得到RNA溶液。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于30 μl,体积过小影响回收效率。RNA溶液请于-70℃保存。配置胶用RNA专用系统。
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