产品货号:
BTN90603A
中文名称:
随机引物法DNA探针标记试剂盒
英文名称:
Random Primer DNA Labeling Kit
产品规格:
5T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是基于随机引物标记法而开发出来的即用型DNA探针标记试剂盒,标记得到的探针长度一般在200~400nt之间(如果模板长度在1kb以上),可以用于Southern杂交、Northern杂交、原位杂交、菌落和斑点印迹杂交等。
Feinberg和Vogelstein发明随机引物标记法,标记过程由双链DNA热变性、随机引物与单链DNA结合、在Klenow DNA聚合酶催化下,引物的延伸合成DNA探针并掺入标记的核苷酸三步组成。
本制品对Feinberg和Vogelstein经典方法进行了改良,具有以下特点:
- 提供的标记反应液整合了除酶和模板外的所有成分,简化了反应加样步骤,提高了标记反应的可重复性。
- 使用无外切活性的Klenow exo- DNA聚合酶,已标记DNA探针不会被酶降解,探针产量更高。
- 最快1小时即可完成标记反应。
- 得到的DNA探针比活性高(如果是同位素,可以达到109 cpm/ug DNA)。
- 所需模版DNA量少,模板可以是线状或环状的、也可以是单链或双链的,但长度必须在100bp以上。
成分 | 规格 |
10×随机引物标记反应液 (自备标记核苷酸型) | 10μL |
Klenow exo-聚合酶 | 5μL |
2mM dATP | 10μL |
2mM dTTP | 10μL |
2mM dGTP | 10μL |
2mM dCTP | 10μL |
标记专用随机引物溶液 | 10μL |
超纯水 | 1mL |
保存:-20℃,有效期1年。
0.5M EDTA(pH8.0),标记的核苷酸。
随机引物标记效率跟起始模板量和保温时间相关,杂交时需要探针DNA必须达到一定的浓度,其中探针/模板比越高,没有标记的模板DNA对杂交的竞争性抑制越低。用户在实验前可以根据下表选择合适的起始模板量和保温时间。
起始模版DNA 用量(ng) | 1小时后探针合成量 (探针模板比) | 20小时后探针合成量 (探针模板比) |
10 | 80ng(8) | 900ng(90) |
30 | 150ng(5) | 1350ng(45) |
100 | 350ng(3.5) | 1650ng(16.5) |
300 | 750ng(2.5) | 2200ng(7.3) |
1000 | 1300ng(1.3) | 2600ng(2.6) |
3000 | 1600ng(0.53) | 2600ng(0.87) |
- 在一干净的硅化的塑料离心管中加入下列成分:
成分 用量 模板DNA 50~150ng 随机引物 2μL 10×随机引物标记反应液 2μL 超纯水 至15μL - 非同位素标记基团(如生物素和地高辛)疏水性强,易与塑料离心管表面非特异性结合,所以要硅化塑料离心管。模板DNA并非越多越好,否则没有标记的模板DNA在杂交时会竞争性地抑制标记DNA跟靶分子的杂交,反而降低杂交信号强度。
- 沸水浴10分钟,或在PCR仪上100℃加热10分钟彻底变性模板DNA,结束后需要立即放冰上待用。不能缓慢降温,否则变性的模板DNA单链又会杂交形成双链。
- 离心数秒使所有液体集中在管底,如果标记物为dTTP则加入除dTTP之外的三种核苷酸(dATP、dGTP、dCTP)各1μL(共3μL,浓度均为2mM),自备的dTTP/标记dUTP混合物1μL,最后加入1μL Klenow exo-聚合酶。如果标记物为dCTP则加入除dCTP之外的三种核苷酸(dATP、dGTP、dTTP)各1μL,以此类推。
- dTTP/标记dUTP混合物中dTTP和标记dUTP的总浓度必须达到2mM,dTTP与生物素标记dUTP或地高辛标记的dUTP的比例在65:35为最佳。但如果使用自备的其他标记核苷酸,如fluorescein、hydroxycoumarin、resorufin和aminoallyl标记的dUTP,则用户需要自己摸索其与dTTP之间的最佳比例,如果使用32P标记的dUTP,则比活最好为3000Ci/mmol,浓度为好为10uCi/μL,并且不需要加入dTTP。
- 轻柔吹打混匀。如有液滴沾在管壁上,离心数秒使所有液体集中在管底。
- 37℃保温1~20小时。反应结束后加热100℃ 5分钟使DNA聚合酶变性,同时使DNA探针变性成单链,然后立即冰上冷冻。不能缓慢降温,否则变性的模板DNA单链又会杂交形成双链。
- 变性后的标记反应液可以放-20℃长期保存,也可以直接加入到杂交反应液中进行杂交。如果电泳检测,标记产物将是弥散状态。
- 本方法标记核苷酸掺入率极高,因此可以不经纯化直接使用。如果需要纯化,不要用酚抽提法纯化非同位素标记的DNA探针,因为这些标记分子(如生物素或地高辛等)疏水性强,能使标记的DNA进入疏水的有机相而丢失。只能选择乙醇直接沉淀或Sephadex G50过柱回收(需另购柱式探针纯化试剂盒)。对比活高的同位素标记探针,由于同位素其极其不稳定,因此应该立即使用,不要长久放置。
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