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RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒图片
产品货号:
KL260114
中文名称:
RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒
英文名称:
RNA Binding Protein Immunoprecipitation Kit
产品规格:
6T
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
简要说明:

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具。该技术主要是运用目标蛋白的特异性抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化对结合在复合物上的RNA进行qPCR验证或者高通量测序分析。



产品组成:
组分规格
RIP裂解缓冲液2.4mL
100×蛋白酶抑制剂15μL
RNA酶抑制剂35μL
蛋白A/G磁珠200μL
1mg/mL正常兔IgG30μL
1mg/mL正常鼠IgG30μL
RIP洗涤缓冲液50μL
0.5M EDTA400μL
盐溶液600μL
DEPC水400μL
洗脱缓冲液800μL

保存:-20℃,有效期1年。

用户自备:
去离子水、BCA蛋白浓度测定试剂盒、0.22mm注射器式滤膜

使用方法:
  • 样本前处理
    1. 准备405μL完全RIP裂解缓冲液(400μL RIP裂解缓冲液+4μL 100×蛋白酶抑制剂+1μL RNA酶抑制剂)
    • 动物细胞:
      1. 收集2×107个细胞样品,加入2mL PBS洗涤细胞,离心后弃上清收集细胞沉淀,预留1/4的细胞样品用于后续input组的RNA提取及纯化。
      2. 向剩余细胞沉淀中加入400μL完全RIP裂解缓冲液重悬,并用移液枪吹打混匀10次,使细胞充分裂解,冰浴30min,每10min涡旋一次,10s/次,4℃ 12000rpm离心10min,取上清,记为裂解产物,并按照150μL(IP)、150μL(IgG)、100μL(input)分成三份,input样本-80℃保存备用。
    • 动物组织:
      1. 取新鲜组织或低温组织(约0.3g),置于预冷的研钵中,加入液氮进行快速研磨至粉末状,并收集到2管无RNase的离心管中,1管约1/4的组织样品预留用于后续input组的RNA提取及纯化。
      2. 向另一管组织粉末中加入400μL完全RIP裂解缓冲液重悬沉淀,用移液枪吹打混匀10次,使组织充分裂解,冰浴30min,每10min涡旋一次,10s/次,4℃ 12000rpm离心10min,取上清,记为裂解产物,并按照150μL(IP)、150μL(IgG)、100μL(input)分成三份,input样品-80℃保存备用。


  • 磁珠准备
    1. 准备2支1.5mL EP管,分别标记IgG管和IP管,将蛋白A/G磁珠原管上下颠倒10次,待磁珠和液体混匀后,分别取出30μL到IgG管和IP管。
    2. 每管加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,置于磁力架上静置1min,弃上清,该步骤操作3次。
    3. 用300μL的RIP洗涤缓冲液重悬磁珠。


  • 磁珠结合抗体
    1. IP管加入3~5μg目的抗体,IgG管加入3~5μg目的抗体相同宿主的IgG,放到静音混合器上室温孵育60min。
    2. 将两管放到磁力架上静置1min,弃上清。加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,在磁力架上静置1min,弃上清,该步骤操作3次。


  • RNA结合蛋白免疫沉淀
    1. 准备1.8mL RIP缓冲液(1720μL RIP洗涤缓冲液+70μL 0.5M EDTA+10μL RNA酶抑制剂);向步骤C所得的IgG管和IP管中分别加入900μL RIP缓冲液,150μL步骤A所得裂解产物,放到静音混合器上,4℃孵育过夜。
    2. 将两管放到磁力架上静置1min,弃上清;将两管各加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,在磁力架上静置1min,弃上清,该步骤操作5次。
    3. 将两管各加入300μL RIP洗涤缓冲液,用移液枪吹打混匀5次,取100μL混合液到新管,标记为A管,剩余液体记为B管,将4管置于磁力架上静置1min,弃上清,A管加100μL洗脱缓冲液,煮沸10min后磁力架上静置1min,取上清到新管,加入10μL 6×上样缓冲液混匀准备WB检测,B管用于纯化RNA,分组设置见下表:
      实验组RIP洗涤缓冲液样本名称体积实验
      lgG300μLlgG-A100μLWB检测
      lgG-B200μLRNA纯化
      IP300μLIP-A100μLRNA纯化
      IP-B200μLRNA纯化


  • RNA纯化
    1. 步骤A预留的input样品和步骤D的IgG-B管与IP-B管中各加入500μL的TrizoL,涡旋混匀,室温静置5min,再加入100μL的氯仿,涡旋混匀,4℃ 14000rpm离心10min,取上层水相(约300μL)到新管,做好标记。
    2. 加入50μL盐溶液,550μL异丙醇混匀,-80℃静置2~4h(亦可静置过夜),使用前放置4℃解冻。
    3. 4℃ 14000rpm离心10min,弃上清,加入500μL 75%乙醇,4℃ 14000rpm离心10min,小心弃掉上清,该步操作3次。
    4. 开盖室温晾干,加10~20μL DEPC水,移液枪吹打,使RNA完全溶解,-80℃保存备用。

  • RIP-qPCR(选作步骤)
    1. 逆转录:按照逆转录试剂盒进行操作。
    2. 反应程序:将Input、IP、IgG逆转录后cDNA分别取1μL加入到PCR反应孔中,每个样品三复孔,其余组分按照SYBR Green qPCR Mix说明书进行添加,加完后做好标记瞬时离心10 s,放入荧光定量PCR仪中上机检测。详细点样方式如下(阳性样本只做GAPDH引物确认是否富集即可):
      123456789
      引物1BinputinputinputIgGIgGIgGIPIPIP
      引物2CinputinputinputIgGIgGIgGIPIPIP
      ......inputinputinputIgGIgGIgGIPIPIP
    3. 结果计算:Fold Enrichment=2^(△△Ct)(以lgG为参照)
      △△Ct=(Ct Ip-Ct input)-(Ct lgc-Ct input)=×(input组目标基因Ct input值作为参照Ct值)则目标基因的IP组表达水平为lgG组的2的负x次方倍。

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