产品货号:
RFT418
中文名称:
单链DNA Ladder(20~75nt)
英文名称:
ssDNA Marker(20-75nt)
产品规格:
25T
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
本制品由不同长度的单链DNA分子混合而成,7条带的大小为20、25、30、35、40、50、75nt。该产品不含有上样缓冲液,可以根据实验需求使用不同的上样缓冲液,用于尿素变性电泳或非变性电泳。本制品附带2×TBE尿素上样缓冲液和2×非变性PAGE DNA上样缓冲液,方便待检样品的上样。
5%尿素变性胶分离单链DNA
lane 1~9分别为10、15、20、25、30、35、40、50、75nt的ssDNA,上样量为0.5μg
lane 10:单链DNA Ladder(20~75nt),预混型,上样量5μL
lane 11:单链DNA Ladder(20~75nt),非预混型,配制后上样量5μL
lane 12:单链DNA Ladder(10~75nt),预混型,上样量5μL
电泳条件:1×TBE,恒压200 V 50min
染色:RealGood Red 后染20min,紫外激发
组分 | 规格 | 保存 |
单链DNA Ladder(20~75nt) | 62.5μL | -20℃ |
2×TBE尿素上样缓冲液 | 1mL | 4℃ |
2×非变性PAGE DNA上样缓冲液 | 1mL | 4℃ |
保存:按标签指示条件保存,有效期2年。
配制好的即用型单链DNA Marker以每次上样5μL计算,该产品可以使用大约25次。
- 即用型单链DNA Ladder(20~75nt)配制方法:
- 进行尿素变性电泳:
即用型单链DNA Ladder(20~75nt) 配制体积20μL 单链DNA Ladder(20~75nt) 10μL 2×TBE尿素上样缓冲液 10μL 混匀,70℃处理5分钟。 - 进行非变性电泳:
即用型单链DNA Ladder(20~75nt) 配制体积20μL 单链DNA Ladder(20~75nt) 10μL 2×非变性PAGE DNA上样缓冲液 10μL 混匀,不用加热处理。
- 进行尿素变性电泳:
- 凝胶制备:
- 以下使用方法均以8×10cm凝胶厚1.0mm示例,其他规格凝胶请适当调整。
- TBE-尿素凝胶制备:
- 可以选择DNA尿素PAGE电泳试剂盒或按照以下程序制胶:
表一:TBE-尿素PAGE分离胶配方表(总体积5mL,适用于厚度1.0mm小板胶)单链DNA长度 最佳凝胶浓度 尿素 40%PAA(29:1) 10×TBE 灭菌水 10%APS TEMED 200~1000nt 5% 2.1g 0.625mL 0.5mL 至5mL 50μL 5μL 50~400nt 8% 1mL 30~300nt 10% 1.25mL 10~150nt 15% 1.875mL 5~120nt 20% 2.5mL - 在凝胶模具中灌入适量分离胶溶液(对于mini-gel,凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5cm或距梳齿约0.5cm即可),然后在分离胶溶液上轻轻覆盖一层1-5cm的水层,使凝胶表面保持平整。
- 静置10~20分钟,待分离胶和水层之间出现一个清晰的界面后,说明凝胶已聚合。
- 凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。
- 去除覆盖在分离胶上的水层;按照表二将不同体积成分在一个小烧杯中混合;最后加入10%过硫酸铵和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。
表二:TBE-尿素PAGE 4%浓缩配方表(总体积2mL,适用于1.0mm厚度胶)凝胶浓度 尿素 40%PAA(29:1) 10×TBE 灭菌水 10%APS TEMED 4% 0.84g 0.2mL 0.2mL 至2mL 20μL 2μL - 将浓缩胶溶液加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端;将梳子插入凝胶内,避免产生气泡。
- 静置30~60分钟,等待浓缩胶聚合。
- 凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。
- 可以选择DNA尿素PAGE电泳试剂盒或按照以下程序制胶:
- 非变性凝胶制备:
- 可以选择非变性PAGE DNA电泳试剂盒或按照以下程序制胶。
- 按照表三将不同体积的成分在小烧杯或试管中混合;最后加入10%APS和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。
- 在凝胶模具中灌入适量分离胶溶液(对于mini-gel,凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5cm或距梳齿约0.5cm即可),然后在分离胶溶液上轻轻覆盖一层1-5cm的水层,使凝胶表面保持平整。
- 静置10~20分钟,待分离胶和水层之间出现一个清晰的界面后,说明凝胶已聚合。
表三:TBE-非变性PAGE分离胶配方表(总体积5mL,适用于厚度1.0mm小板胶)最佳DNA分离范围 凝胶浓度 灭菌水 30%PAA(29∶1) 5×TBE 10%APS TEMED 70~450bp 6% 3mL 1mL 1mL 50μL 5μL 60~460bp 8% 2.66mL 1.34mL 50~300bp 10% 2.33mL 1.67mL 40~200bp 12% 2mL 2mL 25~150bp 15% 1.5mL 2.5mL 5~100bp 20% 0.66mL 3.34mL - 凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。
- 去除覆盖在分离胶上的水层;按照表四将不同体积成分在一个小烧杯或试管中混合;最后加入10%过硫酸铵和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。
表四:TBE-非变性PAGE 4%浓缩配方表(总体积1.5mL,适用于1.0mm厚度胶)凝胶浓度 灭菌水 30%PAA(29∶1) 5×TBE 10%APS TEMED 4% 1mL 200μL 300μL 20μL 2μL - 将浓缩胶溶液加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端;将梳子插入凝胶内,避免产生气泡。
- 静置30~60分钟,等待浓缩胶聚合。
- 凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。
- 可以选择非变性PAGE DNA电泳试剂盒或按照以下程序制胶。
- 样品制备:
根据实验目的,配制即用型单链DNA Marker样品(步骤A)。单链DNA样品使用尿素变性电泳,双链DNA样品使用非变性电泳,单链/双链混合样品使用非变性电泳。 - 电泳:
- 预电泳(可选):电泳槽内外加入适量1×TBE缓冲液稳压200V预电泳30分钟。电泳结束后,用1×TBE缓冲液彻底冲洗加样孔2~3次。
- 上样:根据梳齿确定Marker上样量,一般是10齿1mm厚梳子上样5μL,15齿1mm厚梳子上样3μL。
- 连接电源线,打开电源开关,按照以下条件电泳。
恒电压 起始电流 结束电流 电泳时间 适用条件 推荐电压 200V 15~20mA/板胶 10~15mA/板胶 60+ min 最佳电压,最优的分辨率 - 等待上样缓冲液的溴酚蓝指示前沿到凝胶底部时终止电泳,取出凝胶进行后续实验。
胶浓度 溴酚蓝 二甲苯菁 5% ~35nt ~130nt 8% ~19nt ~75nt 10% ~15nt ~55nt 15% ~10nt ~52nt 20% ~8nt ~35nt
- 预电泳(可选):电泳槽内外加入适量1×TBE缓冲液稳压200V预电泳30分钟。电泳结束后,用1×TBE缓冲液彻底冲洗加样孔2~3次。
- 染色:
用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(货号:RFT204),核酸PAGE电泳染色试剂盒(货号:RFT205)或核酸快速染色试剂盒(货号:RFT206)染色均可以得到清晰的条带分离效果。- 如果使用核酸染料染色,RealGood Red或RealGood All核酸染料结合单链核酸效果最佳,强烈建议使用以便获得最佳效果的胶图。其余染料如GelRed,Goldview,EB等染色效果不好。
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