产品货号:
WH0112
中文名称:
HRM分析试剂盒(EvaGreen饱和染料法)
英文名称:
HRM Analysis Kit(EvaGreen)
产品规格:
20μl×125次|20μl×500次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品结合了饱和染料EvaGreen和抗体酶的优点,是一款适用于高分辨率熔解曲线(HRM)分析的专业试剂盒。本试剂盒是一种2×PreMix,PCR反应液配制十分简单方便;具有分辨率高和模板高度适应性等特点。
与SYBR Green不同,EvaGreen在高浓度情况下不会抑制PCR反应;可以使双链PCR产物的结合量达到饱和状态,所以称为“饱和染料”。不会产生SYBR Green的“染料重排”现象,能够很好的区分扩增产物之间单个碱基的差异。
本试剂盒可用于已知SNP分析,未知突变基因扫描和甲基化PCR分析等研究。
- 采用了抗体修饰的热启动DNA聚合酶,具有高扩增效率,高扩增特异性和宽广的可信范围的特点。
- EVA Green染料在饱和状态下具有很高的溶解曲线分辨率,可以区分单个碱基的变异。
- 独特的Buffer体系进一步增加了溶解曲线的稳定性,提高了扩增的特异性。
- 本制品附带ROX Reference Dye,用于消除信号本底以及校正孔与孔之间产生的荧光信号误差,方便客户针对不同型号荧光定量PCR仪时选择相应浓度使用。
SYBR Green是目前被广泛应用于荧光定量PCR分析的荧光染料,但由于对PCR的抑制较严重,会被控制在较低的使用浓度,SYBR Green与双链DNA的结合处于非饱和状态,所以称为“非饱和染料”。SYBR Green的这种性质会导致在“染料重排”现象的发生,从而影响熔解曲线的分辨率,所以不能够通过熔解曲线区分扩增产物之间单个碱基之间的差异。
EvaGreen是一种同时适用于荧光定量PCR和HRM分析的新一代染料。这种染料通过一种被称为“按要求释放”的全新机制,选择性的结合双链DNA。这一机制保证了较低的PCR抑制作用,同时也允许在染料饱和浓度下进行分辨单碱基差异的HRM分析。
组分 | 20μL×125次 | 20μL×500次 |
2×HRM Analysis PreMix | 1.25mL | 4×1.25mL |
50×ROX Reference Dye | 250μL | 1mL |
RNase-Free ddH2O | 2×1mL | 5×1mL |
保存:-20℃,避光,有效期1年。
收到本试剂盒后,请立即置于-20℃避光保存。从-20℃取出使用时,将冻存的2×HRM Analysis PreMix和50×ROX Reference Dye溶解,然后轻轻颠倒混匀,待溶液完全均一后再行使用。如解冻后没有使用,须彻底混匀后重新冷冻(在解冻过程中盐会出现分层现象,未混匀进行冷冻,盐晶体的析出将会对酶造成损害)。如需一段时间内经常取用,可在2~8℃条件下储存3个月。避免反复多次冻融。
- 本试剂盒中含有荧光染料EvaGreen,保存本试剂盒或配制PCR反应液时应避免强光照射。
- 如果试剂没有混匀,其反应性能会有所下降。使用时请上下颠倒轻轻混匀,请不要使用振荡器进行混匀,尽量避免出现泡沫,并经瞬时离心后使用。
- 引物纯度对反应特异性影响很大,建议使用PAGE级别以上纯化的引物。
- 20μL反应体系中,基因组DNA模板的使用量一般小于100ng,并尽量保持不同反应之间有相同的模量。模板纯度,OD260/280 1.6~2.0,OD260/230 1.5~2.0。
- 由于HRM具有很高的灵敏性,因此在条件允许的情况下推荐使用50μL反应体系,大的反应体系可以提高反应重复性,减少实验误差对熔解曲线的负面影响。
- 引物设计:较短的PCR产物可以提高HRM的分辨率;因此在设计PCR引物时,遵循普遍的原则外,尽量保持产物长度在80~120之间。SNP位点尽量处在PCR产物序列中间位置。
- 建立HRM PCR反应体系:
请注意将2×HRM Analysis PreMix和50×ROX Reference Dye避光保存。- 溶解2×HRM Analysis PreMix (如果保存在-20℃),50×ROX Reference Dye,模板,引物和RNase-Free ddH2O,并将所有试剂在室温下平衡并彻底混匀。
- 建议置于冰上进行HRM PCR反应液的配制,反应体系如下:
成分 50μL体系 20μL体系 终浓度 2×HRM Analysis PreMix 25μL 10μL 1× 正向引物(10μM) 1.5μL 0.6μL 0.3μM 反向引物(10μM) 1.5μL 0.6μL 0.3μM 模板 - - - 50×ROX Reference Dye - - - RNase-Free ddH2O 至50μL 至20μL - - 常用体系为20μL,在条件允许的情况下可50μL反应体系,大的反应体系可以减少实验误差对熔解曲线的负面影响。
- 引物终浓度为0.3μM可以在大多数体系中获得良好的扩增结果。扩增效率不高时,可增加PCR反应体系中的引物浓度;发生非特异扩增时,可适当减少PCR反应体系中的引物浓度。需要进一步优化引物浓度的,可以在0.2~0.5μM范围内调整。
- 由于HRM反应较灵敏,须尽量保持不同样本之间有相同的模板量。
- 几种常见仪器的最适ROX Reference Dye浓度如下:
仪器 终浓度 ABI 7900HT 5×(例如:5μL ROX/50μL体系) ABI 7500 Fast 1×(例如:1μL ROX/50μL体系) Roche LightCycler 480,Qiagen Roter-Gene 无需添加
- 常用体系为20μL,在条件允许的情况下可50μL反应体系,大的反应体系可以减少实验误差对熔解曲线的负面影响。
- 盖上反应管,轻柔混匀。可短暂离心,确保所有组分均在管底。
- 溶解2×HRM Analysis PreMix (如果保存在-20℃),50×ROX Reference Dye,模板,引物和RNase-Free ddH2O,并将所有试剂在室温下平衡并彻底混匀。
- 进行PCR反应
将反应体系置于荧光定量PCR仪中,选择并设置扩增程序,开始反应。
建议采用两步法PCR反应程序进行反应。当出现模板浓度过低引起非特异扩增,引物Tm值较低导致的扩增效率低下或扩增曲线重现性不佳等现象时,建议尝试进行三步法PCR扩增反应。- 两步法反应程序:
阶段 循环 温度 时间 内容 荧光信号采集 预变性 1× 95℃ 2min 预变性 否 PCR反应 40× 95℃ 10sec 变性 否 60℃ 30sec 退火/延伸 是 熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage) - 请先使用60℃ 30sec进行扩增,如出现非特异性扩增,可尝试在60~66℃范围内优化,提高反应特异性。
- HRM在熔解曲线分析时,一般设置为0.02~0.1℃收集一次荧光。
- 请先使用60℃ 30sec进行扩增,如出现非特异性扩增,可尝试在60~66℃范围内优化,提高反应特异性。
- 三步法反应程序:
阶段 循环 温度 时间 内容 荧光信号采集 预变性 1× 95℃ 2min 预变性 否 PCR反应 40× 95℃ 10sec 变性 否 60℃ 20sec 退火 否 72℃ 30sec 延伸 是 熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage) - HRM在熔解曲线分析时,一般设置为0.02~0.1℃收集一次荧光。
- 两步法反应程序:
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