产品货号：
WE0109
中文名称：
Babuddy超保真DNA聚合酶
英文名称：
Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase
产品规格：
100U
发货周期：
已停产
产品价格：
已停产
Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase是一种快速、高扩增效率的高保真DNA聚合酶，具有5'-3'DNA聚合酶活性和3'-5'外切核酸酶活性。经过改造的Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase，其活性区域融合有一段聚合增强结构域，独特的结构极大提升了保真性和延伸速度。Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase的保真性是普通Taq DNA Polymerase的50倍，是普通Pfu的6倍。其延伸速率为15-30 sec/kb，成功克服了普通Pfu酶扩增效率低、扩增速度慢的缺陷，大大缩短了反应时间。本品特别适合于在基因克隆实验中扩增长片段DNA，尤其在扩增>10 kb的DNA片段时，优势更加明显，所扩增的片段最长可达20kb。
本产品中包含两种PCR缓冲液，经过优化的缓冲体系使酶的应用更加广泛，即使以复杂的基因组DNA为模板，也可以保证很高的特异性和长片段的扩增。特有的PCR增强剂DMSO使GC含量高，有二级结构和重复序列的复杂模板也能得到高效扩增。
使用本产品扩增得到的PCR产物的3'端不带有“A”碱基，可直接克隆于平末端载体中。如需进行T/A克隆，需在PCR产物末端添加“A”后进行克隆。本产品具有延伸速度快、扩增效率高、保真性强的特点。适用于基因克隆、基因定点突变、SNP等实验。
产品特点
1、高保真性：保真性是普通Taq DNA Polymerase的50倍，普通Pfu的6倍。
2、扩增速度快：其延伸速率为15-30sec/kb，成功克服了普通Pfu酶扩增效率低、扩增速度慢的缺陷。
3、特别适合于扩增长片段：扩增的片段长度可长达20kb。
产品组成：
注意：本产品的5×Babuddy HF 和GC Buffer中含有7.5 mM镁离子。
活性定义：
在74℃，30分钟内，将10 nmol脱氧核苷酸掺入到酸性不溶物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。
质量控制：
1、核酸内切酶活性检测：50μl反应体系中，10 U本酶与0.2 mM dNTPs和1μg的pUC19质粒于37℃温育4小时，<10%的pUC19质粒由超螺旋变为缺刻状态。
2、7.5 kb基因组DNA PCR扩增：50μl反应体系，1×Babuddy HF Buffer，50ng基因组DNA，1 U Babuddy DNA聚合酶，200μM dNTPs和1μM引物，30个循环PCR扩增出7.5 kb目的片段。
3、20 kb λDNA PCR扩增：50μl反应体系，5×Babuddy HF Buffer，10ng λDNA，1 UBabuddy DNA聚合酶，200μM dNTPs和1μM引物，22个循环PCR扩增出20 kb目的片段。
使用方法：
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件，实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
注意：
1)对于复杂模板或高GC含量的模板，请使用5×Babuddy GC Buffer。
2)可选步骤：对于复杂模板，如高GC含量、带有复杂二级结构的序列，可加入本产品中提供的100%DMSO或其他PCR添加物，以提高扩增效率，推荐终浓度为3%，也可按照2%的浓度递增优化。由于DMSO可以降低引物的Tm值，因此若DMSO使用浓度很高，需降低退火温度。
a.模板：在50μl PCR反应体系中，DNA模板的建议用量为低复杂度模板(如质粒DNA，λDNA等)1 pg- 10ng，高复杂模板(如基因组DNA)50-250ng。
b.引物：引物浓度请以终浓度0.2-1.0μM作为设定范围的参考，推荐终浓度为0.5μM。扩增效率不高的情况下，可提高引物的浓度；发生非特异性反应时，可降低引物浓度，由此优化反应体系。
c.镁离子：镁离子浓度请以终浓度1.5-3 mM作为设定范围的参考。本产品的 5×Babuddy HF Buffer和GC Buffer中已经含有7.5 mM镁离子，可根据dNTP浓度、引物和模板来调整，由此优化反应体系。若引物或模板中有螯合剂(如EDTA)存在，则应提高镁离子浓度。若需要对镁离子浓度进行优化时，可使用本产品中提供的MgCl2按照0.5 mM浓度梯度逐步调整。
d.dNTPs：反应体系中dNTPs的浓度一般为每种200μM，使用本品时，不推荐使用dUTP和带有尿嘧啶的引物或模板。
e.Babuddy酶的浓度：Babuddy酶推荐的使用浓度为1 U/50μl 反应体系，可在0.5-2 U/50μl 反应体系之间优化酶的浓度。
2、PCR反应条件
常规三步法PCR反应：
a．变性：简单模板的预变性温度为98℃，预变性时间为30 s。对于比较复杂的模板，预变性时间可延长至3分钟。
b．退火：使用本产品时，退火温度设定的基本原则是，当引物长度小于或等于20 nt时，退火温度为引物最低的Tm；当引物长度大于20 nt时，退火温度应在最低Tm的基础上以Tm+3℃退火10-30 s。当无法得到理想的扩增效率时，应以最低的Tm值逐步提升至模板延伸温度。对于Tm高的引物可以使用两步法PCR。
c．延伸：延伸时间应根据所扩增片段的长度和模板复杂程度设定，本产品中所包含的Babuddy DNA Polymerase扩增效率为2-4 kb/min，复杂性低的模板可用4 kb/min，复杂性高的基因组DNA模板，延伸时间则应为2 kb/min，对于一些cDNA模板，延伸时间可增加到1.5 kb/min。
d．循环次数：可根据扩增产物的下游应用设定循环数。如果循环次数太少，扩增量不足；如果循环次数太多，错配机率会增加，非特异性背景严重。所以，在保证产物得率的前提下，应尽量减少循环次数。
当引物的退火温度较高时，建议使用两步法进行PCR扩增：
储存条件：-20℃，避免反复冻融。
相关搜索：Babuddy超保真DNA聚合酶，Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase
本产品中包含两种PCR缓冲液，经过优化的缓冲体系使酶的应用更加广泛，即使以复杂的基因组DNA为模板，也可以保证很高的特异性和长片段的扩增。特有的PCR增强剂DMSO使GC含量高，有二级结构和重复序列的复杂模板也能得到高效扩增。
使用本产品扩增得到的PCR产物的3'端不带有“A”碱基，可直接克隆于平末端载体中。如需进行T/A克隆，需在PCR产物末端添加“A”后进行克隆。本产品具有延伸速度快、扩增效率高、保真性强的特点。适用于基因克隆、基因定点突变、SNP等实验。
产品特点
1、高保真性：保真性是普通Taq DNA Polymerase的50倍，普通Pfu的6倍。
2、扩增速度快：其延伸速率为15-30sec/kb，成功克服了普通Pfu酶扩增效率低、扩增速度慢的缺陷。
3、特别适合于扩增长片段：扩增的片段长度可长达20kb。
产品组成：
| 组份 | 20μl×250次(100 U) |
| Babuddy DNA Polymerase，2U/μl | 50μl |
| 5×Babuddy HF Buffer | 1.5ml |
| 5×Babuddy GC Buffer | 1.5ml |
| 100% DMSO | 0.5ml |
| 50 mM MgCl2 | 1.5ml |
注意：本产品的5×Babuddy HF 和GC Buffer中含有7.5 mM镁离子。
活性定义：
在74℃，30分钟内，将10 nmol脱氧核苷酸掺入到酸性不溶物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。
质量控制：
1、核酸内切酶活性检测：50μl反应体系中，10 U本酶与0.2 mM dNTPs和1μg的pUC19质粒于37℃温育4小时，<10%的pUC19质粒由超螺旋变为缺刻状态。
2、7.5 kb基因组DNA PCR扩增：50μl反应体系，1×Babuddy HF Buffer，50ng基因组DNA，1 U Babuddy DNA聚合酶，200μM dNTPs和1μM引物，30个循环PCR扩增出7.5 kb目的片段。
3、20 kb λDNA PCR扩增：50μl反应体系，5×Babuddy HF Buffer，10ng λDNA，1 UBabuddy DNA聚合酶，200μM dNTPs和1μM引物，22个循环PCR扩增出20 kb目的片段。
使用方法：
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件，实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
| 试剂 | 20μl反应体系 | 50μl反应体系 | 终浓度 |
| 5×Babuddy HF Buffer | 4μl | 10μl | 1× |
| dNTP Mix，2.5 mM each | 1.6μl | 4μl | 200μM each |
| Forward Primer，10μM | 1μl | 2.5μl | 0.5μM |
| Reverse Primer，10μM | 1μl | 2.5μl | 0.5μM |
| Template DNA | 适量 | 适量 | <250ng |
| 100% DMSO | 0.6μl | 1.5μl | 3% |
| Babuddy DNA Polymerase | 0.2 μl | 0.5μl | 1 U/50μl |
| ddH2O | up to 20μl | up to 50μl |
注意：
1)对于复杂模板或高GC含量的模板，请使用5×Babuddy GC Buffer。
2)可选步骤：对于复杂模板，如高GC含量、带有复杂二级结构的序列，可加入本产品中提供的100%DMSO或其他PCR添加物，以提高扩增效率，推荐终浓度为3%，也可按照2%的浓度递增优化。由于DMSO可以降低引物的Tm值，因此若DMSO使用浓度很高，需降低退火温度。
a.模板：在50μl PCR反应体系中，DNA模板的建议用量为低复杂度模板(如质粒DNA，λDNA等)1 pg- 10ng，高复杂模板(如基因组DNA)50-250ng。
b.引物：引物浓度请以终浓度0.2-1.0μM作为设定范围的参考，推荐终浓度为0.5μM。扩增效率不高的情况下，可提高引物的浓度；发生非特异性反应时，可降低引物浓度，由此优化反应体系。
c.镁离子：镁离子浓度请以终浓度1.5-3 mM作为设定范围的参考。本产品的 5×Babuddy HF Buffer和GC Buffer中已经含有7.5 mM镁离子，可根据dNTP浓度、引物和模板来调整，由此优化反应体系。若引物或模板中有螯合剂(如EDTA)存在，则应提高镁离子浓度。若需要对镁离子浓度进行优化时，可使用本产品中提供的MgCl2按照0.5 mM浓度梯度逐步调整。
d.dNTPs：反应体系中dNTPs的浓度一般为每种200μM，使用本品时，不推荐使用dUTP和带有尿嘧啶的引物或模板。
e.Babuddy酶的浓度：Babuddy酶推荐的使用浓度为1 U/50μl 反应体系，可在0.5-2 U/50μl 反应体系之间优化酶的浓度。
2、PCR反应条件
常规三步法PCR反应：
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s-3 min | |
| 变性 | 98℃ | 5-10 s | 25-35 个循环 |
| 退火 | 45-72℃ | 10-30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 2-4 kb/min | |
| 终延伸 | 72℃ | 5-10 min |
a．变性：简单模板的预变性温度为98℃，预变性时间为30 s。对于比较复杂的模板，预变性时间可延长至3分钟。
b．退火：使用本产品时，退火温度设定的基本原则是，当引物长度小于或等于20 nt时，退火温度为引物最低的Tm；当引物长度大于20 nt时，退火温度应在最低Tm的基础上以Tm+3℃退火10-30 s。当无法得到理想的扩增效率时，应以最低的Tm值逐步提升至模板延伸温度。对于Tm高的引物可以使用两步法PCR。
c．延伸：延伸时间应根据所扩增片段的长度和模板复杂程度设定，本产品中所包含的Babuddy DNA Polymerase扩增效率为2-4 kb/min，复杂性低的模板可用4 kb/min，复杂性高的基因组DNA模板，延伸时间则应为2 kb/min，对于一些cDNA模板，延伸时间可增加到1.5 kb/min。
d．循环次数：可根据扩增产物的下游应用设定循环数。如果循环次数太少，扩增量不足；如果循环次数太多，错配机率会增加，非特异性背景严重。所以，在保证产物得率的前提下，应尽量减少循环次数。
当引物的退火温度较高时，建议使用两步法进行PCR扩增：
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s-3 min | |
| 变性 | 98℃ | 5-10 s | 25-35 个循环 |
| 延伸 | 72℃ | 2-4 kb/min | |
| 终延伸 | 72℃ | 5-10 min |
储存条件：-20℃，避免反复冻融。
相关搜索：Babuddy超保真DNA聚合酶，Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase