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FFPE直接RT-PCR试剂盒图片
产品货号:
BTN131176
中文名称:
FFPE直接RT-PCR试剂盒
英文名称:
FFPE direct RT-PCR Kit
产品规格:
30T
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
本试剂盒免核酸提取,直接用切片裂解液做RT-PCR模板。本试剂盒足够处理30次样品处理和50次的RT-PCR反应。

试剂盒特点:
  • 反转录可灵活选用随机引物、Oligo dT引物或专一引物,适合各种情况。
  • PCR mix含有上样染料,所以PCR产物可直接上样电泳。
  • 两管式操作,RT和PCR分步进行,便于单独优化RT反应和PCR反应的条件。
  • 扩增效率高,最高可扩增1kb以上的RNA。


试剂盒组成:
组分规格
免RNA提取FFPE溶液A30mL
免RNA提取FFPE溶液B18mL
MMLV(含RI)100μL(红盖)
RT Buffer(含dNTP)250μL(白盖)
Oligo (dT)18引物(0.5μg/uL)50μL(绿盖)
随机引物(0.2μg/uL)50μL(本色盖)
RNase-free水1mL(亮黄盖)
PCR MagicMix 3.0,含染料1mL(红盖)

保存条件:-20℃保存,有效期一年。

使用方法:

一、样品RNA的释放
  1. 如果有N个样品,可设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用水作为制备的阴性对照,提取结束后最后得到模板DNA放冰上待用。
  2. 将5片厚度为6~8μm的石蜡包埋组织切片转移到1.5mL塑料离心管(最好使用螺旋盖离心管)中并加入1mL溶液A,在振荡器上以最大速度振荡10秒,然后离心。
  3. 取出上一步的上清液0.6mL,加入0.6mL的溶液B,震荡5~10秒。
  4. 室温放置10分钟。
  5. 混合液可以直接用做PCR、RT-PCR、LAMP和RT-LAMP扩增的模板。未用完的部分模板可以放-80℃长期保存。


二、RT反应合成cDNA
  1. 按下表配制RT反应体系(20μL体系):
    成分用量
    RNA模板总RNA100~500ng
    或poly(A) mRNA10~500ng
    或专一的RNA(如体外转录制备的)0.01pg~500ng
    引物Oligo (dT)18(0.5μg/μL)1μL
    或随机引物(0.2μg/μL)1μL
    或自备模板专一反向引物(10pmol/μL)1~2μL
    RNase-free水至12μL

    注意:RNA样品不能含有基因组DNA污染。随机引物与RNA模板的比例将决定cDNA合成的平均长度(成反比)。一般情况下随机引物效率好于OligodT引物,但如果只想转录总RNA中的mRNA(只占5%左右),则可优先选用OligodT引物,这样就可以排除非mRNA的干扰。
  2. 70℃保温5分钟变性模板后立即冰浴。
  3. 按顺序加入6μL RT Buffer(含dNTP)和2μL MMLV逆转录酶(含RI),反应终体积为20μL。
  4. 42℃保温60分钟。此步为RT反应。
  5. 70℃保温10分钟以终止反应,然后放置在冰上待用。
  6. 合成的cDNA可以直接作为PCR模板使用,不需要纯化。剩余样品可以放置在-20℃长期保存。


三、PCR反应(30μL体系)
  1. 将全部专用染料加入到PCR MagicMix 3.0中,轻柔颠倒混匀即可使用。未用完的部分需要在-20℃。也可以不加专用染料,但在PCR结束
    后,电泳上样前,则需要加入电泳上样液,否则电泳时没法判断电泳速
    度。
  2. 在PCR管中加入下列成分:
    成分用量
    PCR MagicMix 3.015μL
    cDNA样品(上步的RT反应液)1~5μL
    模板专一性正向引物(10pmol/μL)1~2μL
    模板专一性反向引物(10pmol/μL)1~2μL
    RNase-free水至30μL

    注意:cDNA也可以稀释后用作PCR模板。是否稀释或稀释多少倍完全取决于靶基因的丰度。
  3. PCR反应参数(需要根据模板和引物决定,下面的只做参考):
    过程温度时间
    预变性95℃5min
    PCR反应(35个循环)95℃30sec
    55℃30sec
    72℃20sec
    最后延伸72℃7min


四、电泳检测
  1. 取5~10μL PCR产物直接在PAGE或琼脂糖凝胶上电泳,跟分子量标准比较估计出扩增产物的大小。注:本试剂盒中的PCR mix含有甘油和染料,可以直接上样,不需要额外再加电泳上样液。

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