产品货号:
WH0234
中文名称:
反转录试剂盒(去除基因组DNA)
英文名称:
Quicking RT Kit(gDNase)
产品规格:
20μl×25T|20μl×100T|20μl×1000T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒是一种高效、稳定、快速并可以去除基因组DNA污染的反转录系统。本试剂盒含有高效去除基因组DNA的gDNase;通过42℃,3min即可去除gDNA,有效避免Total RNA中基因组DNA的干扰。本试剂盒所含的高效反转录酶Quicking RT Enzyme,是通过分子改造后的新型反转录酶,特别增加了疏水motif,具有更强的RNA亲和性和热稳定性,从而进一步提高了其反转录效率和反应速率,42℃、15min即可完成cDNA第一链的合成。另外,由于新型酶与RNA亲和力的增强,使其在通读GC含量高,二级结构复杂的RNA模板和抗逆性等方面的表现也更为的突出。
- 反转录效率高:反转录效率可达95%以上;
- 操作简单快速:反应体系配制简单,21min完成cDNA第一链的合成;
- 通读复杂模板:能够作用于GC含量高,二级结构复杂的RNA模板;
- 样品普适性高:对不同物种来源及杂质较多的RNA模板的适用性高;
- 后续兼容性好:后续配合荧光定量检测产品,灵敏度高、稳定性好。
RT-PCR;荧光定量RT-PCR;cDNA文库构建;SAGE(基因表达连续分析);引物延伸。
图1.使用本试剂盒及国外A公司同类产品(右)反转录小鼠RNA,使用我公司Real-Time PCR预混反应液(货号:WH0103)进行定量MM5基因,展示扩增曲线和熔解曲线。RNA使用量分别为1000ng,100ng,10ng,1ng。结果显示,本试剂盒反转录梯度清晰,Ct值靠前,并且对于低丰度模板(1ng,蓝色箭头)的反转录具有明显优势。
图2.使用本试剂盒及A公司同类产品分别反转录大鼠的正常RNA样本(红色),酚类残留量大的RNA样本(绿色),和醇类残留量大的RNA样本(蓝色),使用我公司Real-Time PCR预混反应液(货号:WH0103)进行定量RNC基因,展示扩增曲线和平均Ct值。结果显示,本试剂盒反转录后定量Ct值靠前,并且抗逆性优秀,对于高杂质残留的模板具有明显优势。
组分 | 25T | 100T | 1000T |
5×gDNA Buffer | 50μL | 200μL | 10×200μL |
FQ-RT Primer Mix | 50μL | 200μL | 10×200μL |
Quicking RT Enzyme Mix | 25μL | 100μL | 10×100μL |
10×King RT Buffer | 50μL | 200μL | 10×200μL |
RNase-Free ddH2O | 1mL | 2×1mL | 10×2×1mL |
保存:-20℃,有效期一年。
- 下列操作步骤适用于模板量为50ng~2μg的总RNA,如果总RNA量大于2μg,请按比例扩大反应体系。
- 在冰上进行操作,防止RNA发生降解。
- 不需分开变性和退火两个步骤。但是对于二级结构很复杂的RNA模板,推荐使用变性步骤,即在操作步骤之前,将模板RNA在65℃孵育5min后迅速转移到冰上,进行下一步操作。
- 根据实验需求不同,也可以选用Oligo-dT Primer或Gene Specific Primer,引物使用量如下:
Oligo-dT Primer 50pmol/20μL反应体系,Gene Specific Primer 5pmol/20μL反应体系。 - 使用Gene Specific Primer时,反转录反应可设置为42℃,15min。当PCR反应有非特异性扩增时,将反转录温度升到50℃会有改善。
- 反转录体系可以根据需要相应扩大。
使用快速反转录试剂盒合成第一链cDNA 50ng~2μg总RNA可建立20μL反应体系。
- 将模板RNA在冰上解冻;5×gDNA Buffer、FQ-RT Primer Mix、10×King RT Buffer、RNase-Free ddH2O在室温(15~25℃)解冻,解冻后迅速置于冰上。使用前将每种溶液涡旋振荡混匀,简短离心以收集残留在管壁的液体。
以下操作步骤请在冰上进行。为了保证反应液配制的准确性,进行各项反应时,应先配制成Mix,然后再分装到每个反应管中。 - 按下表的基因组DNA的去除体系配制混合液,彻底混匀。简短离心,并置于42℃,孵育3min。然后置于冰上放置。
成分 用量 5×gDNA Buffer 2μL Total RNA - RNase-Free ddH2O 至10μL - 按下表的反转录反应体系配制混合液。
成分 用量 10×King RT Buffer 2μL Quicking RT Enzyme Mix 1μL FQ-RT Primer Mix 2μL RNase-Free ddH2O 至10μL - 将反转录反应中的Mix,加到gDNA去除步骤的反应液中,充分混匀。
- 42℃,孵育15min。
- 95℃,孵育3min之后放于冰上,得到的cDNA可用于后续实验,或低温保存。
- 若后续实验为实时荧光定量PCR,逆转录产物的加量应不超过PCR体系终体积的1/10,例如50μL的PCR反应体系,逆转录产物的加量应不超过5μL。
- 将逆转录产物置于冰上,再进行后续PCR反应;如果需要长时间保存,请置于-20℃。
- 若后续实验为实时荧光定量PCR,逆转录产物的加量应不超过PCR体系终体积的1/10,例如50μL的PCR反应体系,逆转录产物的加量应不超过5μL。
对RNA模板的要求:
逆转录酶以RNA为模板合成第一链cDNA,模板RNA的质量和数量直接影响逆转录的结果。
- 模板的完整性:模板RNA的完整性对逆转录非常重要,若RNA模板中含有RNase酶将降解模板RNA,最后导致cDNA产物的量少甚至无cDNA产物。
- 模板的纯度:若RNA模板中含有蛋白、盐离子、EDTA、乙醇、酚等杂质,将影响逆转录酶的活性,最后影响逆转录结果。
- 模板的加量:以下操作步骤适用于模板RNA量为50ng~2μg,如果模板RNA的量大于2μg,请按比例扩大反应体系。
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