产品货号:
KL230378
中文名称:
DNA片段化试剂盒(酶切法)
英文名称:
DNA Fragmentation Kit
产品规格:
20T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是利用酶法对DNA进行片段化的试剂盒。
保存:-20℃,有效期1年。
电泳上样缓冲液,推荐使用Orange G作为电泳示踪剂,因为溴酚蓝(BPB)和二甲苯青(Xylene Cyanol)与DNA片段重叠,应避开使用。
一、基因组DNA片段化反应
二、末端平滑化反应
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- 即开即用,用户不用单独购买各种成分并进行优化。
- 操作简便省时,只需要在样本中加入片段化酶,再反应一段时间即可。
- 跟后续的高通测序(NGS)兼容。
- 安全无毒,本试剂盒对人体无毒,无腐蚀性和刺激性气味。
组分 | 规格 |
DNA片段化试剂盒(酶切法) | 20T |
片段化酶1 | 20μL |
片段化酶1稀释液 | 1040μL |
DNA片段化溶液A | 20μL |
DNA片段化溶液B | 50μL |
DNA片段化反应终止液 | 400μL |
150mM MgCl2溶液 | 40μL |
片段化酶2稀释液 | 200μL |
片段化酶2 | 20μL |
DNA级EDTA溶液 | 50μL |
超纯水 | 1mL×10 |
保存:-20℃,有效期1年。
电泳上样缓冲液,推荐使用Orange G作为电泳示踪剂,因为溴酚蓝(BPB)和二甲苯青(Xylene Cyanol)与DNA片段重叠,应避开使用。
一、基因组DNA片段化反应
- 确定反应体积。
- 基因组DNA在100ng以下使用10μL反应体系;基因组DNA在100ng~1μg之间使用20μL反应体系。
- 基因组DNA超过1μg时,以1μg/20μL的反应体系增加反应管数或扩大反应体系,很好地为5μg/100μL。
- 将2台Thermal Cycler PCR仪的温度分别设定为16℃和70℃。只有1台仪器时设定为16℃。
- 在冰上将基因组DNA以外的下列试剂添加到0.2mL反应管中,配制混合液,充分混匀后再加入基因组DNA。用移液枪轻轻吸打或用手轻弹管壁,离心后使用,避免产生气泡,不能使用振荡器混匀。
成分 用量 片段化酶1稀释液 1.9μL DNA片段化溶液A 1μL DNA片段化溶液B 1μL 自备的基因组DNA 1μg 超纯水 至19μL - 以上为基因组DNA 1μg/20μL反应体系;如果基因组DNA量少,那么要调整为适合的体系。
- 片段化酶1的稀释(使用前新鲜调制)。稀释方法如下:在冰上按下列顺序在1.5mL反应管中加入450μL超纯水和50μL片段化酶1稀释液,充分混匀。轻轻振荡离心。将1μL的片段化酶1加入到配好的混合液中,然后将200μL的移液枪调到100μL刻度后,轻轻吸打10次左右,避免产生气泡。再上下颠倒混匀(5次以下),离心。不能使用振荡器混匀。
- 稀释后的片段化酶1请在10分钟内使用,不能保存。
- 确认Thermal Cycler PCR仪的温度在16℃后,将1μL稀释后的片段化酶1添加到上述加入基因组DNA的混合液中。吸打数次后,立即在16℃条件下进行反应。推荐反应时间5~8分钟。
- 在冰上进行试剂添加和混匀的操作。
- 不要移动反应管,在Thermal Cycler PCR仪上直接加入20μL的DNA片段化反应终止液终止反应。用移液枪吸打2~3次后,再转移到冰上吸打数次。
- 确认Thermal Cycler PCR仪温度为70℃后,将吹打后溶液的0.2mL反应管转移到PCR仪上。
- 70℃反应5分钟后,转移到冰上。
- 在冰上放置2分钟以上。
- 只进行DNA片段化反应时,在冰上放置后的0.2mL反应管中加入1μL的0.5M EDTA溶液,用移液枪吸打,充分混匀后,进行DNA片段的精制。
二、末端平滑化反应
- 将两台扩增仪分别设定为16℃和70℃。如果只有一台,则设定为16℃。
- 片段化酶2的稀释(使用前调制)。稀释方法:在冰上准备0.2mL反应管,试剂按下述的比例(片段化酶2稀释液:片段化酶2=9:1)配成混合液后,轻轻吸打,充分混匀,避免产生气泡。
- 在在冰上放置后的0.2mL反应管中加入2μL的150mM MgCl2溶液,移液枪吸打,充分混匀,避免产生气泡。不能使用振荡器混匀。
- 将2μL稀释后的片段化酶2添加到0.2mL反应管中,吸打数次混匀后,立即在16℃反应10分钟。
- 此步操作在冰上进行。
- 反应结束后,把0.2mL反应管转移到冰上。只有一台扩增仪时,把温度调至70℃。
- 加入1μL的0.5M EDTA溶液,充分吸打混匀后离心。
- 确认Thermal Cycler PCR仪设定的温度为70℃后,将0.2mL反应管转移到Thermal Cycler PCR仪上反应5分钟。
- 将0.2mL反应管转移到冰上。
- 片段化DNA的确认:取相当于200~250ng量基因组DNA(在冰上放置后)的反应液约10μL进行1.5%琼脂糖凝胶电泳。
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