产品货号:
WH0016
中文名称:
石蜡包埋组织DNA快速提取试剂盒(特殊无毒脱蜡方式)
英文名称:
DNA rapid extraction kit from Paraffin-embedded tissue
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒采用特殊的脱蜡方式和裂解条件释放组织切片中的DNA,从最大程度上减少了因福尔马林交联对DNA的损伤。此外,采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统进行FFPE DNA提取。整个过程不涉及有机试剂二甲苯,安全可行、简单快速;提取的基因组完整性好,纯度高,质量稳定可靠。
- 方便快捷:整个操作过程在1h内完成。
- 安全可行:不涉及二甲苯等有机试剂,无毒无害。
- 经济高效:无需蛋白酶K消化,独特的裂解液和特异的吸附柱提取高纯度的DNA。
- PCR和荧光定量PCR。
- SNP基因分析和STR基因分析。
- 药物基因组学研究。
组分 | 规格 |
裂解液GL | 30mL |
缓冲液GP | 3mL |
缓冲液GD | 13mL |
漂洗液PW | 15mL |
洗脱缓冲液TE | 15mL |
RNase-Free吸附柱CR2 | 50个 |
收集管(2mL) | 50个 |
保存:室温,干燥,有效期1年。
- 拿到样品后要尽快在4~10%的福尔马林中固定,固定时间以8~24h为宜,时间过长导致基因组断裂,影响下游实验。
- 确保包埋前的样品彻底脱水,残留的福尔马林会抑制PCR检测酶的作用。
- 第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明在缓冲液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇!所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
- 本制品所提DNA的完整性依赖于样本类型、储存时间以及固定条件。如果甲醛固定时间过长或样本存放时间过久(>1年)则易导致DNA完整性受损,无法扩出长片段。
- 若裂解液GL、缓冲液GD中有沉淀,使用前可在37℃水浴中预热10min以溶解沉淀,不影响效果。
- 试剂盒中各试剂在使用前应按照说明书要求操作。
- DNA含量极低的石蜡包埋组织样本推荐使用石蜡包埋组织DNA提取试剂盒(二甲苯脱蜡)进行提取。
- 样本处理
- 石蜡切片:取石蜡切片(5~10μm厚,1×1cm2大小)5~8张。
- 石蜡块:手术刀刮取约30mg的组织样本(尽量去除多余的石蜡)。
- 如果样品表面暴露于空气中,最初刮取的2~3片弃掉不用。
- 福尔马林等固定液中的样本:取30mg样本,用手术刀切为数块,置于1.5mL离心管中,加入500μL PBS (10mM,pH7.4)涡旋振荡混匀12000rpm(~13400×g)室温离心1min,弃上清,重复3次。
- 石蜡切片:取石蜡切片(5~10μm厚,1×1cm2大小)5~8张。
- 将样本装于1.5mL无菌离心管中,加入500μL裂解液GL,再加入50μL缓冲液GP,剧烈涡旋10sec。
- 98℃孵育30min,期间颠倒混匀3次,直至样品完全溶解。
- 水浴请用长镊子操作。
- 12000rpm(~13400×g)室温离心5min。
- 使用200μL枪头沿管壁小心吸取中间层的水相清液于新的离心管中(上层是石蜡及蛋白混合物,下层为少许杂质沉淀,如果分层不彻底可以延长离心时间,直到上层混合物和水相清液很好的分开)。
- (可选步骤)如果要去除RNA,可以将样品中加入2μL RNase A(100mg/mL),室温孵育2min后,进行下一步操作。
- 加入2倍体积的无水乙醇(例:450μL水相清液加入900μL无水乙醇),充分混匀,静置3min。
- 将上一步所得的混合液加入一个吸附柱CR2中,8000rpm(~6000×g)室温离心2min,倒掉收集管中的废液,重新将吸附柱放回收集管中。
- 吸附柱最大容量为700μL,可将剩余液体重复上述步骤上柱。
- 向吸附柱CR2中加入500μL缓冲液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),8000rpm(~6000×g)室温离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
- 向吸附柱CR2中加入600μL漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),8000rpm(~6000×g)室温离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
- 重复操作步骤10。
- 将吸附柱CR2放回收集管中,12000rpm(~13400×g),离心2min,倒掉废液。将吸附柱开盖置于室温放置2~5min,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
- 乙醇残留会抑制后续的酶反应,所以晾干时要确保乙醇挥发干净。但也不要干燥太长时间,以免难以洗脱DNA。
- 将吸附柱CR2转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加65℃预热的30~100μL洗脱缓冲液TE或ddH2O洗脱,室温放置2~5min,12000rpm (~13400×g)离心2min,将收集有DNA的离心管-20℃保存。
- 洗脱缓冲液体积不应少于30μL,体积过小影响回收效率。为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CR2中,室温放置2min,12000rpm(~13400×g)离心2min。洗脱液的pH对于洗脱效率有很大影响。若用ddH2O做洗脱液应保证其pH值在7.0~8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率;且DNA产物应保存在-20℃,以防DNA降解。
石蜡包埋组织DNA快速提取试剂盒和国外知名A公司同类产品所提DNA,经PCR扩增190、300、750bp片段结果比较。后续PCR扩增效率于国外同类产品相当。
实验材料:小鼠肝脏组织石蜡切片(10μm)样本起始量:5张10μm厚切片
实验方法:按照本试剂盒说明书操作
实验结果:提取后洗脱体积50μL,上样量5μL。反应体系(PCR):20μL以上为提取的DNA为模板,分别进行190bp,300bp和750bp PCR扩增图
M:Marker,胶浓度为1%,6V/cm电泳20min。
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