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本制品是百奥莱博公司以探针法qPCR技术为基础开发的专门用于埃希氏菌属研究检测的试剂盒。

埃希氏菌属(Escherichia spp.)是革兰氏阴性细菌中的一类，其中最为知名的是大肠杆菌。它主要存在于人类和动物的肠道中，是正常肠道菌群的一部分。埃希氏菌属与其他菌群共同维持肠道的稳态平衡，参与食物消化和营养吸收过程。它可以与厌氧菌共生，分解单糖、二糖和复杂多糖，为肠道提供能量和营养物质。此外，埃希氏菌属还参与清除氧气，维持肠道的厌氧环境。埃希氏菌属在婴儿肠道中占据主导地位，可能是因为其具有上述功能，能够适应婴儿肠道的特殊环境。然而，某些埃希氏菌属和梭状芽孢杆菌属的菌株与严重的胃肠道疾病(如炎症性肠病和腹泻)有关。埃希氏菌属的影响不仅局限于肠道，还可以通过肠-脑轴对大脑功能产生影响。研究发现，埃希氏菌属的异常增加与焦虑、抑郁等精神疾病的发生有关，因此快速检测埃希氏菌属具有重要的意义。

1. 即开即用，用户只需要提供样品DNA模板。
   
2. 引物和探针经过优化，分析灵敏度高，可以达到100拷贝/反应。
   
3. 提供阳性对照，便于区分假阴性样品。
   
4. 特异性高，引物是根据埃希氏菌属DNA高度保守区设计，不会跟其他生物的DNA发生交叉反应。
   
5. 既可用于定性检测，又可用于定量检测。定量检测时线性范围至少为5个数量级。

1. 标记6个离心管，分别为6、5、4、3、2、1。
   
2. 用带芯枪头分别加入45μL荧光PCR专用模板稀释液，最好用带芯枪头，下同。
   
3. 在6号管中加入5μL 10⁷拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供)，充分震荡1分钟，得10⁶拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
   
4. 换枪头，在5号管中加入5μL 10⁶拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡1分钟，得10⁵拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
   
5. 换枪头，在4号管中加入5μL 10⁵拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡1分钟，得10⁴拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
   
6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。

7. 如果有N个样品，最好设置N+2个提取，多出的一个是PC(样品制备阳性对照)，一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10μL上步所得第4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次样本制备所要求的起始样本体积一样，以此作为PC。另外用水作为NC。
   
8. 用自选方法纯化样品的DNA，本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容，也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。

9. 如果做定量分析并且只做1次重复，则标记N+9个PCR管，其中N+2个用于上步得到的N+2个样品，1个用于PCR阴性对照(用水做模板)，6个用于标准曲线。
   如果做定性分析并且只做1次重复，则标记N+4个PCR管，其中N+2个用于上步得到的N+2个样品，1个用于PCR阴性对照(用水做模板)，1个用于PCR阳性对照(直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
   
10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照，并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加)：
    

    成分	样品管 N+2个	PCR 阴性对照	标准曲线样品管 (1～6管)
    2×Probe qPCR MasterMix	各10μL	10μL	各10μL
    埃希氏菌属通用qPCR引物-探针混合液	各3μL	3μL	各3μL
    N+2个待测DNA样本	各7μL	不加	不加
    超纯水	不加	7μL	不加
    第6步所得标准曲线样品稀释液(1～6号)	不加	不加	各7μL

11. 盖上盖子后上机，按下面参数进行qPCR：
    

    过程	温度	时间
    预变性	95℃	10min.
    PCR反应 (40个循环)	95℃	15sec.
    	60℃	30sec(采集FAM通道的荧光信号， 淬灭基团为TAMRA)

12. 如果样本制备阳性对照或PCR阳性对照(包括标曲样本)结果为阴性，则整个实验无效，不需要分析数据，需要重新样本制备，重新进行PCR扩增或跟厂家联系。如果样本制备阴性对照或PCR阴性对照结果为阳性，说明环境污染，则整个实验无效，不需要分析数据，需要跟厂家联系。
    
13. 如果阴性对照和阳性对照均正常，则实验有效，可以进入后续分析。
    
14. 如果把本试剂盒用于定量检测，则以阳性对照浓度的log值为横轴，以Ct值为纵轴，绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值，再推算出其浓度。
    
15. 如果把本试剂盒用于定性检测，只判断阳性或阴性，则阴性对照Ct必须没有读数，或者大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长，有典型扩增曲线，Ct值应该小于40。对待测样品，如果其Ct没有读数、大于或等于40则均为阴性，如果小于40则为阳性。