本方案作为microRNA定量研究的金标准,具有高特异性、高灵敏度的特点。主要把包括三个部分:microRNA提取,TaqMan microRNA反转录和荧光定量(TaqMan探针法)
一、一步法microRNA提取技术,仅通过上柱、结合、洗脱即可获得高纯度的小RNA(<200nt),无需额外去除大RNA,由该方法获得的小RNA尤其适合于miRNA的定量PCR试验,适用于动物、植物、细胞、全血等样本的小RNA提取。
二、TaqMan microRNA反转录试剂盒:操作简单,仅需两步即可完成miRNA cDNA的合成。同时,采用加A法进行miRNA的反转录,其转录效率远高于茎环法,因此可极大的提高检测灵敏度。
三、microRNA荧光定量PCR试剂盒(TaqMan探针法):采用FAM标记TaqMan探针和特异性上游引物进行miRNA定量检测,有效的确保了扩增的高特异性和高灵敏度。
本解决方案示意图:配套产品:方案实例:1.极佳的线性关系,高灵敏度
图1:连续6个浓度梯度(100pM、10pM、1pM、100fM、10fM、1fM)miR-21、miR-7和miR-16标准品,使用
microRNA荧光定量PCR试剂盒(TaqMan探针法)进行检测,结果表明具有极好的线性关系(R>0.98)
2.100个细胞(低样本量)的miRNA检测
图2:消化离心正常培养的A594肺癌细胞,通过细胞计数取100个细胞.采用快速组织细胞microRNA提取试剂盒(MT0001)提取该100个细胞的microRNA (洗脱体积25μL) 。取4μL提取的microRNA, 采用TaqMan microRNA反转录试剂盒(MT0006)反转录获得microRNA的cDNA. 取2μL的cDNA产物使用microRNA荧光定量PCR试剂盒(TaqMan探针法)来检测hsa-miR-1(货号:MTT01113)、 hsa-let-7e(货号:MTT01341)、hsa-miR-302b(货号:MTT01466)、内参使用RNU68(货号:MTT01501)。结果表明,使用本解方案可清晰检测到100个细胞的microRNA分子(高信噪比)。采用传统茎环法(SYBR Green)均无法检测到。
3.全血样本的miRNA检测
图3:用全血microRNA提取试剂盒(MT0002)提取150μL抗凝全血的microRNA(洗脱体积20μL)。取4μL提取的microRNA, 采用TaqMan microRNA反转录试剂盒(MT0006)反转录获得microRNA的cDNA。取2μL的cDNA产物使用microRNA荧光定量PCR试剂盒(TaqMan探针法)来检测hsa-miR-7(货号:MTT01346)、hsa-miR-21(货号:MTT01108)、hsa-miR-9(货号:MTT01109)、内参使用hsa-miR-16(货号:MTT01109)。结果表明,使用本解方案可清晰检测到样本中的microRNA分子(高信噪比)。